Simulación de los mínimos de interacción de cafeína con las bases de los ácidos nucleicos y sus rutas de transición
Resumen
La cafeína influye en un amplio conjunto de procesos biológicos. Para explicar los mecanismos moleculares de esta influencia realizamos cálculos de la energía de interacción de cafeína con fragmentos de los ácidos nucleicos por los métodos de la mecánica molecular. Los cálculos revelan tres tipos de arreglos de mínimos de energía de interacción entre cafeína y las bases (pares de bases) del ADN. Además de las conocidas posiciones mutuas de apilamiento (stacking), se encontraron otros dos tipos de arreglos; planos y perpendiculares. Estos dos arreglos son posibles para monómeros de ácidos nucleicos individuales y dúplex de ADN. Además se encontraron las rutas de transición entre los mínimos locales de interacción CAF-base. Los cálculos sugieren una posible influencia de la cafeína en la interacción del ADN con otras moléculas biológicamente activas, a través de la formación de complejos con pares de bases y ligandos.
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